Documentation fichiers de configuration pour OpenADOM

Documentation décrivant la structure du fichier de configuration de l’application OpenADOM

Date de publication

21 octobre 2025

Ecriture de la documentation

  • Vous pouvez utiliser visual studio code et l’extention for quarto.
  • Vous pouvez aussi utilise rstudio

Pour compiler certaine pages on doit rajouter les framework R rmarkdown et knitr

    Rscript -e "install.packages(c('rmarkdown', 'knitr'), repos='https://cloud.r-project.org')"

Reportez vous à la documentation de Quarto

Ecrire une page

Ouvrez un nouveau document et donnez lui un nom avec de préférence le suffixe .qmd (quarto markdown).

Ajoutez une balise meta

---
title: Le titre
subtitle: le sous titre 
abstract: le résumé
---

Créer une ancre

Pour faire référence à un paragraphe, une image ou autre de votre page rajoutez un identifiant (ancre)

    Créer une ancre {#ancre}

Pour éviter à devoir réécrire tous les liens, on va mettre dans le fichier _variables.yml tous le liens que l’on utilisera. Ce sera le point unique pour les modifier.

page-refs:
    index: 
        ancre:  "[Créer une ancre](/index.qmd)" #chemin absolu depuis openadom

pour utilise cette ancre:

{{ <var page-refs.index.ancre> }} sans espaces

-> Créer une ancre

Ajouter un block

::: {.callout-note #block1 .titleModal collapse="false" style="border:red 2px solid"}

ceci est un block
:::
Note

ceci est un block

::: {.callout-note #block2  collapse="false" style="border:blue 2px solid; color:pink; background: yellow"}
ceci est un block
:::
Note

ceci est un block

Importer un fichier

Il est important que les fichiers fournis (blocs de code) puissent être sortis, afin d’être réutilisé.

On les mets dans un dossier fichiers. pour les importer

    ::: {.callout-warning collapse="false" title="Les parcelles"}
    ``` text
    {{ < include fichiers/examples/basicComponents/fichiers/tr_parcelles_par.csv >}} sans l'espace
    ```
    :::
Les parcelles 
nom du site;nom de la parcelle
bassin_versant__site1      ;1
bassin_versant__site2      ;1

Il est possible s’inclure ce fichier csv sous forme de table

Types de sites
Code 
#dans un bloc {r}
knitr::kable(read.csv("fichiers/examples/basicComponents/fichiers/tr_parcelles_par.csv", header = TRUE,  sep = ';',  stringsAsFactors = FALSE))
Les parcelles
nom.du.site nom.de.la.parcelle
bassin_versant__site1 1
bassin_versant__site2 1

On peut aussi ne choisir que d’afficher certaines lignes

computed component: sit_site
Code 
# dans un bloc {r}
yaml_content <- suppressWarnings(readLines("fichiers/examples/basicComponents/fichiers/tr_parcelles_par.csv"))
yaml_content <- yaml_content[2:3]
cat(yaml_content, sep = "\n")
bassin_versant__site1      ;1
bassin_versant__site2      ;1

Insérer une image

::: {layout-ncol=2}
![Petit logo](img/Logos_OA.png){width=50}

![Grand logo](img/Logos_OpernADOM.svg){width=50}
:::

Petit logo

Grand logo

Ajouter un page dans le menu

On ajoute les pages dans le fichier _quarto.yaml

Dans la section sidebar: -> contents

  sidebar:
    contents:
      - section: Introduction
        contents:
          - text: Introduction
            href: fichiers/introduction/introduction.qmd
          - text: Vocabulaire
            href: fichiers/introduction/vocabulaire.qmd
  • section ajoute un nouveau dossier
  • text le texte à afficher
  • href le chemin vers le fichier
  • —- une ligne de séparation
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